研究室概要

福永研究室では、計算機科学の力を利用して大規模生命科学データから新たな生物学的知見を見出すバイオインフォマティクスの研究を行っています。 特に、機能性RNA解析、微生物ゲノム解析、ゲノム配列解析について、アルゴリズム開発からデータ解析、ウェット実験まで幅広いアプローチで研究を進めています。

News

・2025/08/31-09/02 ECCB2026にて、下記の発表を行います。

　・ポスター発表:☆Kentaro Morihira, Yusuke Hiki, Tsukasa Fukunaga: Predicting riboswitches using deep learning.

・2025/07/08-10 第27回日本RNA学会年会にて、下記の発表を行います。

　・ポスター発表:☆Nodoka Isobe, Yusuke Hiki, Tsukasa Fukunaga: Sampling of RNA Pseudo-Knot Structures Using GFLowNet.

　・ポスター発表:☆Ken Aoki, Yusuke Hiki, Tsukasa Fukunaga: Transcriptome-Scale Analysis of RNA Pseudoknot Structures.

　・ポスター発表:☆Kentaro Morihira, Yusuke Hiki, Tsukasa Fukunaga: Predicting riboswitches using deep learning.

・2026/06/15 東京大学の浅井研究室との共同研究として、構造プロファイルを計算するCapRをビームサーチを用いて線形アルゴリズムにしたLinearCapRを開発した論文がBioinformatics誌より出版されました!

・2026/04/01 助教、短期留学生(修士一年相当)、五名の学部四年生が新しく研究室に加わりました!人数も増えて賑やかになってきましたが、楽しく研究を進めていきましょう！